提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
高铁车厢过小年：旅“兔”增年味 新规“悦”旅途******
(新春走基层)高铁车厢过小年：旅“兔”增年味 新规“悦”旅途
中新网长沙1月15日电 题：高铁车厢过小年：旅“兔”增年味 新规“悦”旅途
作者 鲁毅 金阳 章秋
小年纳福瑞，归途享年味。1月15日，农历腊月二十四，是中国南方小年，从湖南株洲西开往上海虹桥的G1348次列车上，车厢内张灯结彩，窗花、对联、一只只可爱又喜庆的小兔子贴画爬上座椅、跃上窗台，处处洋溢着浓浓的兔年年味。
该趟列车由中国铁路广州局集团有限公司长沙客运段动车二队G11/G12组值乘，“兔年”味十足的车厢是他们为旅客准备的节日祝福。
8时54分，G1348次列车准点从株洲西站驶出，列车工作人员为旅客们准备的小年“大餐”也正式开始。
工作人员向乘客讲解铁路新规。2023年春运，是新版《铁路旅客运输规程》(以下简称新规)实施后迎来的首个春运。一堂“新春迎新规”宣讲小课堂成为小年“大餐”的“头菜”。青年列车长丁利首先向旅客们发放新规宣传手册，提醒出行注意事项，讲解购票乘车新规定的具体内容，随后，又组织乘客参与铁路新规知识抢答。
“年满多少周岁的儿童应当购买全价票？”
“14岁！”
“学生优惠票哪些时间可以购买？”
“学生优惠票不再规定乘车时间限制，每学年的任意时间都可以！”
……
“一问一答间，铁路新规就被旅客记住了！”团员列车员袁婧璐趁着现场氛围正热，还号召旅客将新规手册分享至朋友圈和家庭群，让更多人了解铁路新规的便民惠民措施，并为抢答成功和点赞数多的旅客送上列车新春礼包。
“这一趟出行收获颇多，详细了解了铁路新规定的变化点，知道出行需要注意的地方，让我们这些带小孩出门的家长更加安心、省心。”捧着刚收到的新春礼包，旅客刘先生难掩喜悦。
春节期间，疫情防控更加不能松懈。党员列车长师彪为大家讲解出行期间防护知识，示范正确佩戴口罩和洗手“七步法”。
高铁车厢里过小年。 长沙客运段动车二队供图最后，青年列车长陈想带领着乘务员肖琳和何全喜为乘客带来一段热情四射的手势舞，为出行的旅客送去温暖与欢乐。同时，一张张新年“福”字、一袋袋寓意兔年吉祥的大白兔奶糖等送到了乘客手上。一时间，歌声、欢笑声充满了车厢。
全程参与的旅客黄女士激动地说：“已经有两年没回家过年了，这次在列车上和大家一起贴窗花，让我想到以前在老家，过年前要将剪好的窗花贴在屋子里，给家里增添过年的喜气。感谢铁路工作人员让我提前体验了回家的温暖，这次经历也一定会成为我春运回家路上最美好的回忆！”
小小一张火车票，一站是旅途，一站是家乡。列车长陈想说：“为乘客服务，践行‘悦旅途，悦精彩’的服务理念，是每一位铁路工作人员的责任，我们会在每一次值乘中，积极宣传新规利好，提升服务质量、延伸服务内容，让旅客体验更美好的出行。”(完)
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